1993年9月，国务院决定南充地区进行行政区划调整，撤销四川省南充地区行政公署，建立南充市（地级市），将原南充市、南充县划为南充市高坪、顺庆、嘉陵三区。随着嘉陵区的建立， 1993年10月，南充市嘉陵区人民检察院正式建立。

南充市嘉陵区人民检察院现有干警50名，院领导6名（其中检察长1名，副检察长3名。政治部主任1名、党组成员1名）；员额检察官17名，检察辅助人员18名（其中检察官助理11人，书记员2名，司法警察5名），司法行政人员9名，有工勤人员6名；聘用制书记员13名。三类人员平均年龄在45岁。并有5个基层党组织（其中，机关党委1个，在职党员支部3个，退休党员支部1个），现有党员54名（其中，在职党员32名，退休党员20名，家属党员2名）。内设机构改革后，2019年11月25日将内设机构设置为5个。即：办公室、第一检察部（未成年人刑事检察部）、第二检察部（公益诉讼检察部）、第三检察部、政治部。